Em quais circunstâncias devo formatar o HD? O que é formatar? E os Bad blocks o que são e como resolver? O que é a partição? O que é rótulo do disco?
Vamos entender o HD de uma forma simples.
No modo lógico o HD se compõe de rótulo, partição e formatação.
Um HD quando se compra vem já formatado, isto quer dizer que vem com um rótulo, uma partição e uma formatação.
O rótulo é a primeira fase de preparação de dados;
Sobre ela é colocada a partição, onde divide o HD em setores;
E em seguida a formatação que divide a partição em setores, trilhas e cilindro.

Bad blocks o que são e como resolver?
O HD quando testado na fábrica já vem com bad blocks (não existe hd sem bad blocks) só que marcados e ocultos (por isso que um HD quando se usa percebe-se que tem uma capacidade menor do que indicado).
Com o uso, por uma instabilidade ou interferência, a cabeça se obriga a fazer diversas tentativas de leitura, inclusive reduzindo a velocidade de giro e quase sempre gerando o bad block.
Os HDs atuais são capazes de marcar automaticamente os setores defeituosos numa area do disco chamada defect map.
Uma vez criado, quando a cabeça tenta passar por ele, tenta recuperá-lo causando maior demora ou inconsistência do sistema.
Neste caso, é interessante formatar o HD para que a cabeça passe diretamente sobre esse erro, ignorando-o.
Importante acentuar que quando começam a aparecer esses bad blocks, se não forem rsolvidos com formatação, significa que está na hora de se pensar em um novo HD, pois esse erro é quase sempre irrecuperável mesmo com uma formatação de baixo nível ou mais agressiva.

O que é formatar?
A formatação é a forma lógica de se reescrever as trilhas e setores da partição, simplesmente apagando-a (formatação rápida) ou realmente reescrevendo-a (formatação completa) sem realoca-la.
Como os mais entendidos sabem que um vírus pode se alojar entre esse setores e/ou trilhas, a formatação nem sempre é eficaz, podendo ainda deixa-los para que numa oportunidade voltem ao nosso convívio e baguncem tudo.

O que é a partição?
A partição é a base para a formatação.
Do ponto de vista do sistema operacional, cada partição é uma unidade separada, entendendo como se houvessem um,dois ou mais discos rígidos instalados de acordo com o número de partições.
Cada partição possui seu próprio diretório raiz e sua formatação.
As informações sobre o número de partições, localização no disco, e o espaço ocupado, são armazenadas na tabela de partição, que compartilha o primeiro setor do disco com o setor de boot.
Quando se reparticiona o HD, então se retira os setores e trilhas, sendo este, obrigado a refazer o processo da formatação, criando-se novos setores e trilhas, acabando em 90% os riscos de vírus persistentes entre esses setores e trilhas como já foi dito.

O que é rótulo do disco? ou Tabela MFT?
O rótulo do disco ou tabela MFT é a base para a colocação da partição e formatação.
Quando fazemos um trabalho de limpeza, em primeiro lugar é feito o backup dos dados para outro HD, verificação de vírus, back doors, spywares, trojans e rootkits neste segundo HD, seguido da troca do rótulo do disco do primeiro, colocação da partição e sua formatação, instalação do S.O., e recolocação do backup garantindo em 100% a limpeza do hd.